رایج ترین عمل برای نوزادان پسر عمل ختنه می باشد که در آن پوست اضافی سر کلاهک آلت تناسلی کودک رو بر میدارند.ختنه نوزاد از طریق روشهای مختلفی صورت می پذیرد که در تمام این روشها به وجود یک دکتر ختنه متخصص کلینیک تخصصی برای انجام فرآیندهای لازم احتیاج می باشد. در توصیه و آموزه های دینی هم گفته شده که باید فرزاندان پسر خود را ختنه کنید در نتیجه این عمل در ایران نیز بسیار رواج دارد. در بسیاری از کشور های دنیا که اعتقادات مذهبی و دینی نیز وجود ندارد، این عمل انجام می شود.